Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIK2Q13002 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIK2Q13002 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GRIK2Q13002 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
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