Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CGNL1Q0VF96 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
CGNL1Q0VF96 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CGNL1Q0VF96 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CGNL1Q0VF96 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms