Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMAGPQ0VAQ4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SMAGPQ0VAQ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMAGPQ0VAQ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms