Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSC1Q08554 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSC1Q08554 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DSC1Q08554 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms