Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNK2Q07912 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TNK2Q07912 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TNK2Q07912 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TNK2Q07912 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms