Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIN1Q05586 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
GRIN1Q05586 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIN1Q05586 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms