Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT17Q04695 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT17Q04695 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT17Q04695 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms