Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ATP7AQ04656 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ATP7AQ04656 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ATP7AQ04656 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.32■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ATP7AQ04656 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ATP7AQ04656 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms