Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GBE1Q04446 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GBE1Q04446 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GBE1Q04446 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms