Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EXOSC10Q01780 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EXOSC10Q01780 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EXOSC10Q01780 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms