Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FAM3AP98173 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FAM3AP98173 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FAM3AP98173 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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