Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD3P84022 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD3P84022 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD3P84022 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD3P84022 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms