Protein–RNA interactions for Protein: P69905

HBA1, Hemoglobin subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBA1P69905 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HBA1P69905 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HBA1P69905 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HBA1P69905 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HBA1P69905 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HBA1P69905 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBA1P69905 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBA1P69905 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBA1P69905 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBA1P69905 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBA1P69905 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBA1P69905 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBA1P69905 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBA1P69905 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HBA1P69905 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBA1P69905 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HBA1P69905 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBA1P69905 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBA1P69905 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBA1P69905 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBA1P69905 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HBA1P69905 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HBA1P69905 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HBA1P69905 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HBA1P69905 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBA1P69905 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBA1P69905 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBA1P69905 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HBA1P69905 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBA1P69905 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HBA1P69905 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HBA1P69905 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HBA1P69905 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HBA1P69905 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HBA1P69905 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HBA1P69905 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HBA1P69905 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HBA1P69905 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HBA1P69905 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HBA1P69905 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HBA1P69905 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HBA1P69905 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HBA1P69905 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HBA1P69905 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBA1P69905 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBA1P69905 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HBA1P69905 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HBA1P69905 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HBA1P69905 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HBA1P69905 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HBA1P69905 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HBA1P69905 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HBA1P69905 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms