Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TUBB4BP68371 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4BP68371 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB4BP68371 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4BP68371 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms