Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ERVK-21P61565 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ERVK-21P61565 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERVK-21P61565 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms