Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SNAP25P60880 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SNAP25P60880 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SNAP25P60880 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms