Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCDC1P59894 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCDC1P59894 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCDC1P59894 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms