Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV3P56539 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAV3P56539 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAV3P56539 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CAV3P56539 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAV3P56539 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAV3P56539 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAV3P56539 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CAV3P56539 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CAV3P56539 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CAV3P56539 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAV3P56539 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAV3P56539 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAV3P56539 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CAV3P56539 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAV3P56539 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAV3P56539 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CAV3P56539 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAV3P56539 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CAV3P56539 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAV3P56539 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAV3P56539 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAV3P56539 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CAV3P56539 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CAV3P56539 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CAV3P56539 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CAV3P56539 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV3P56539 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV3P56539 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV3P56539 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV3P56539 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV3P56539 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CAV3P56539 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV3P56539 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV3P56539 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV3P56539 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CAV3P56539 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms