Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUMO3P55854 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SUMO3P55854 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SUMO3P55854 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SUMO3P55854 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUMO3P55854 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUMO3P55854 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SUMO3P55854 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SUMO3P55854 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SUMO3P55854 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUMO3P55854 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUMO3P55854 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUMO3P55854 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUMO3P55854 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUMO3P55854 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUMO3P55854 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SUMO3P55854 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUMO3P55854 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUMO3P55854 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUMO3P55854 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUMO3P55854 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SUMO3P55854 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.1 ms