Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SEC13P55735 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC13P55735 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC13P55735 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC13P55735 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC13P55735 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC13P55735 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC13P55735 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC13P55735 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC13P55735 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC13P55735 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC13P55735 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC13P55735 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC13P55735 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC13P55735 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC13P55735 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC13P55735 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC13P55735 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC13P55735 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC13P55735 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC13P55735 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC13P55735 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC13P55735 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC13P55735 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC13P55735 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC13P55735 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC13P55735 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC13P55735 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC13P55735 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC13P55735 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC13P55735 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC13P55735 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC13P55735 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC13P55735 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC13P55735 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC13P55735 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC13P55735 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC13P55735 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC13P55735 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC13P55735 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC13P55735 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC13P55735 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC13P55735 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC13P55735 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC13P55735 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC13P55735 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC13P55735 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC13P55735 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEC13P55735 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms