Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EMP1P54849 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
EMP1P54849 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP1P54849 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP1P54849 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP1P54849 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP1P54849 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP1P54849 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
EMP1P54849 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
EMP1P54849 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
EMP1P54849 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EMP1P54849 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMP1P54849 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMP1P54849 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMP1P54849 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMP1P54849 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMP1P54849 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EMP1P54849 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EMP1P54849 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms