Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RARSP54136 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RARSP54136 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RARSP54136 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RARSP54136 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RARSP54136 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RARSP54136 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RARSP54136 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RARSP54136 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RARSP54136 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RARSP54136 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RARSP54136 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RARSP54136 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RARSP54136 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RARSP54136 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RARSP54136 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RARSP54136 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RARSP54136 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RARSP54136 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RARSP54136 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RARSP54136 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RARSP54136 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RARSP54136 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RARSP54136 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RARSP54136 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RARSP54136 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RARSP54136 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RARSP54136 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RARSP54136 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
RARSP54136 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RARSP54136 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RARSP54136 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RARSP54136 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RARSP54136 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RARSP54136 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RARSP54136 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RARSP54136 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RARSP54136 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RARSP54136 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RARSP54136 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RARSP54136 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RARSP54136 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RARSP54136 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
RARSP54136 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RARSP54136 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RARSP54136 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RARSP54136 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RARSP54136 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RARSP54136 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RARSP54136 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RARSP54136 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RARSP54136 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RARSP54136 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARSP54136 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARSP54136 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARSP54136 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARSP54136 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARSP54136 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RARSP54136 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms