Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX5P50542 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PEX5P50542 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PEX5P50542 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX5P50542 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX5P50542 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX5P50542 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PEX5P50542 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PEX5P50542 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX5P50542 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX5P50542 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX5P50542 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PEX5P50542 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PEX5P50542 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PEX5P50542 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX5P50542 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX5P50542 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PEX5P50542 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PEX5P50542 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PEX5P50542 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX5P50542 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX5P50542 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX5P50542 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX5P50542 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX5P50542 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PEX5P50542 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX5P50542 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX5P50542 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX5P50542 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX5P50542 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX5P50542 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX5P50542 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PEX5P50542 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX5P50542 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX5P50542 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PEX5P50542 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX5P50542 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX5P50542 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX5P50542 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX5P50542 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PEX5P50542 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX5P50542 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX5P50542 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX5P50542 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX5P50542 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX5P50542 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PEX5P50542 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PEX5P50542 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PEX5P50542 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms