Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NUP153P49790 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
NUP153P49790 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NUP153P49790 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUP153P49790 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUP153P49790 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUP153P49790 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUP153P49790 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUP153P49790 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NUP153P49790 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUP153P49790 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUP153P49790 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
NUP153P49790 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NUP153P49790 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NUP153P49790 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NUP153P49790 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NUP153P49790 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NUP153P49790 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUP153P49790 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUP153P49790 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUP153P49790 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NUP153P49790 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NUP153P49790 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NUP153P49790 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NUP153P49790 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
NUP153P49790 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NUP153P49790 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NUP153P49790 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NUP153P49790 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NUP153P49790 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NUP153P49790 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NUP153P49790 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NUP153P49790 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NUP153P49790 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NUP153P49790 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NUP153P49790 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
NUP153P49790 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NUP153P49790 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NUP153P49790 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NUP153P49790 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NUP153P49790 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NUP153P49790 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP153P49790 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP153P49790 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP153P49790 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP153P49790 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
NUP153P49790 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP153P49790 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NUP153P49790 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP153P49790 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP153P49790 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP153P49790 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NUP153P49790 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP153P49790 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP153P49790 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP153P49790 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NUP153P49790 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUP153P49790 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NUP153P49790 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
NUP153P49790 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NUP153P49790 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP153P49790 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP153P49790 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP153P49790 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NUP153P49790 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP153P49790 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP153P49790 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP153P49790 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP153P49790 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP153P49790 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
NUP153P49790 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP153P49790 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP153P49790 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP153P49790 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP153P49790 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP153P49790 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NUP153P49790 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP153P49790 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP153P49790 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP153P49790 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP153P49790 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP153P49790 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP153P49790 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NUP153P49790 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms