Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRIM1P49642 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRIM1P49642 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRIM1P49642 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms