Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK8P49336 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK8P49336 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK8P49336 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK8P49336 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK8P49336 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK8P49336 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK8P49336 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK8P49336 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK8P49336 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK8P49336 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK8P49336 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK8P49336 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK8P49336 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK8P49336 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK8P49336 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK8P49336 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK8P49336 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK8P49336 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK8P49336 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK8P49336 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK8P49336 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDK8P49336 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK8P49336 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK8P49336 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK8P49336 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK8P49336 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK8P49336 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK8P49336 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK8P49336 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK8P49336 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK8P49336 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK8P49336 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK8P49336 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK8P49336 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK8P49336 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK8P49336 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK8P49336 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK8P49336 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK8P49336 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK8P49336 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK8P49336 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK8P49336 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK8P49336 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK8P49336 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK8P49336 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK8P49336 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK8P49336 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK8P49336 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK8P49336 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK8P49336 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK8P49336 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDK8P49336 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK8P49336 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK8P49336 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK8P49336 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK8P49336 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK8P49336 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK8P49336 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK8P49336 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK8P49336 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK8P49336 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK8P49336 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK8P49336 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK8P49336 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK8P49336 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDK8P49336 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK8P49336 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK8P49336 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDK8P49336 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK8P49336 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK8P49336 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK8P49336 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDK8P49336 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms