Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPD2P43304 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GPD2P43304 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPD2P43304 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPD2P43304 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GPD2P43304 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPD2P43304 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPD2P43304 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPD2P43304 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GPD2P43304 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPD2P43304 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPD2P43304 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GPD2P43304 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPD2P43304 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPD2P43304 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPD2P43304 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPD2P43304 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GPD2P43304 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPD2P43304 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPD2P43304 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPD2P43304 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GPD2P43304 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPD2P43304 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPD2P43304 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GPD2P43304 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GPD2P43304 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPD2P43304 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPD2P43304 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPD2P43304 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPD2P43304 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GPD2P43304 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPD2P43304 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GPD2P43304 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPD2P43304 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPD2P43304 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GPD2P43304 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GPD2P43304 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPD2P43304 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GPD2P43304 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPD2P43304 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPD2P43304 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPD2P43304 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPD2P43304 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GPD2P43304 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPD2P43304 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPD2P43304 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPD2P43304 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPD2P43304 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPD2P43304 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPD2P43304 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GPD2P43304 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GPD2P43304 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPD2P43304 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPD2P43304 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPD2P43304 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GPD2P43304 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GPD2P43304 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPD2P43304 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPD2P43304 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPD2P43304 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPD2P43304 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPD2P43304 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GPD2P43304 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GPD2P43304 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPD2P43304 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPD2P43304 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPD2P43304 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPD2P43304 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GPD2P43304 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPD2P43304 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPD2P43304 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPD2P43304 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPD2P43304 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GPD2P43304 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPD2P43304 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GPD2P43304 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPD2P43304 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GPD2P43304 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms