Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP2P42575 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP2P42575 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP2P42575 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP2P42575 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP2P42575 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP2P42575 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP2P42575 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP2P42575 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP2P42575 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP2P42575 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP2P42575 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP2P42575 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP2P42575 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CASP2P42575 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CASP2P42575 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP2P42575 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP2P42575 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP2P42575 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP2P42575 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP2P42575 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP2P42575 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP2P42575 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP2P42575 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP2P42575 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP2P42575 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP2P42575 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP2P42575 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP2P42575 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP2P42575 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms