Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIK3CBP42338 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.8 ms