Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA2P42262 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GRIA2P42262 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRIA2P42262 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms