Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BMI1P35226 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BMI1P35226 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BMI1P35226 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
BMI1P35226 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMI1P35226 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMI1P35226 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMI1P35226 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMI1P35226 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMI1P35226 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BMI1P35226 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BMI1P35226 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BMI1P35226 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BMI1P35226 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BMI1P35226 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BMI1P35226 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
BMI1P35226 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
BMI1P35226 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMI1P35226 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMI1P35226 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BMI1P35226 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMI1P35226 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMI1P35226 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMI1P35226 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BMI1P35226 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms