Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX1P32242 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX1P32242 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX1P32242 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX1P32242 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX1P32242 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX1P32242 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX1P32242 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX1P32242 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX1P32242 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
OTX1P32242 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX1P32242 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX1P32242 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
OTX1P32242 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
OTX1P32242 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OTX1P32242 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OTX1P32242 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX1P32242 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX1P32242 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OTX1P32242 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OTX1P32242 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OTX1P32242 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX1P32242 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX1P32242 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX1P32242 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OTX1P32242 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX1P32242 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX1P32242 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX1P32242 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX1P32242 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
OTX1P32242 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX1P32242 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX1P32242 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX1P32242 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX1P32242 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX1P32242 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
OTX1P32242 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms