Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CLIP1P30622 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CLIP1P30622 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CLIP1P30622 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms