Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF4BP23588 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF4BP23588 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms