Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TNNI1P19237 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNNI1P19237 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms