Protein–RNA interactions for Protein: P15169

CPN1, Carboxypeptidase N catalytic chain, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPN1P15169 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CPN1P15169 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CPN1P15169 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPN1P15169 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CPN1P15169 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CPN1P15169 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CPN1P15169 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPN1P15169 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPN1P15169 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPN1P15169 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPN1P15169 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPN1P15169 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CPN1P15169 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CPN1P15169 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CPN1P15169 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CPN1P15169 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CPN1P15169 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPN1P15169 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CPN1P15169 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms