Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRAFP15056 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRAFP15056 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRAFP15056 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRAFP15056 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRAFP15056 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRAFP15056 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRAFP15056 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRAFP15056 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRAFP15056 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRAFP15056 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRAFP15056 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRAFP15056 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRAFP15056 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRAFP15056 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRAFP15056 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRAFP15056 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRAFP15056 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRAFP15056 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms