Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TRIM27P14373 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
TRIM27P14373 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRIM27P14373 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms