Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GP1BBP13224 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GP1BBP13224 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GP1BBP13224 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms