Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RLBP1P12271 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RLBP1P12271 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RLBP1P12271 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RLBP1P12271 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms