Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
COL11A1P12107 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL11A1P12107 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL11A1P12107 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms