Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COX6A1P12074 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
COX6A1P12074 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 449.9 ms