Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VDRP11473 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VDRP11473 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VDRP11473 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VDRP11473 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VDRP11473 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VDRP11473 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VDRP11473 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VDRP11473 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VDRP11473 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VDRP11473 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VDRP11473 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VDRP11473 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VDRP11473 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VDRP11473 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VDRP11473 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VDRP11473 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VDRP11473 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VDRP11473 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VDRP11473 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VDRP11473 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VDRP11473 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VDRP11473 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VDRP11473 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VDRP11473 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VDRP11473 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VDRP11473 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VDRP11473 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VDRP11473 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VDRP11473 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VDRP11473 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VDRP11473 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VDRP11473 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VDRP11473 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VDRP11473 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VDRP11473 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VDRP11473 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VDRP11473 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VDRP11473 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VDRP11473 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VDRP11473 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VDRP11473 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VDRP11473 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VDRP11473 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VDRP11473 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VDRP11473 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VDRP11473 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
VDRP11473 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VDRP11473 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VDRP11473 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VDRP11473 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VDRP11473 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VDRP11473 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VDRP11473 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VDRP11473 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VDRP11473 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VDRP11473 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VDRP11473 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VDRP11473 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VDRP11473 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VDRP11473 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
VDRP11473 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
VDRP11473 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VDRP11473 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VDRP11473 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
VDRP11473 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VDRP11473 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VDRP11473 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
VDRP11473 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VDRP11473 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
VDRP11473 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
VDRP11473 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VDRP11473 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VDRP11473 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VDRP11473 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VDRP11473 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VDRP11473 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms