Protein–RNA interactions for Protein: P11171

EPB41, Protein 4.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41P11171 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPB41P11171 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPB41P11171 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPB41P11171 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EPB41P11171 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPB41P11171 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPB41P11171 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPB41P11171 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPB41P11171 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EPB41P11171 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EPB41P11171 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB41P11171 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB41P11171 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB41P11171 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB41P11171 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB41P11171 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB41P11171 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EPB41P11171 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB41P11171 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB41P11171 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB41P11171 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EPB41P11171 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB41P11171 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB41P11171 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB41P11171 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB41P11171 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB41P11171 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB41P11171 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPB41P11171 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB41P11171 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB41P11171 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB41P11171 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB41P11171 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB41P11171 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPB41P11171 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPB41P11171 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPB41P11171 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPB41P11171 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB41P11171 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB41P11171 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB41P11171 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB41P11171 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPB41P11171 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPB41P11171 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPB41P11171 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPB41P11171 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPB41P11171 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
EPB41P11171 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EPB41P11171 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms