Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GZMBP10144 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GZMBP10144 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GZMBP10144 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GZMBP10144 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GZMBP10144 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GZMBP10144 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GZMBP10144 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GZMBP10144 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GZMBP10144 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GZMBP10144 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GZMBP10144 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GZMBP10144 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GZMBP10144 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GZMBP10144 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GZMBP10144 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GZMBP10144 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GZMBP10144 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GZMBP10144 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GZMBP10144 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GZMBP10144 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GZMBP10144 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GZMBP10144 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GZMBP10144 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GZMBP10144 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GZMBP10144 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GZMBP10144 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GZMBP10144 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GZMBP10144 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GZMBP10144 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GZMBP10144 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GZMBP10144 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms