Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GIMD1P0DJR0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GIMD1P0DJR0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMD1P0DJR0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms