Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC6P09630 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC6P09630 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC6P09630 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HOXC6P09630 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HOXC6P09630 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HOXC6P09630 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HOXC6P09630 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms