Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COL4A2P08572 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL4A2P08572 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
COL4A2P08572 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms