Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGRP06401 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGRP06401 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGRP06401 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGRP06401 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGRP06401 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGRP06401 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGRP06401 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PGRP06401 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGRP06401 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGRP06401 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGRP06401 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGRP06401 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGRP06401 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PGRP06401 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PGRP06401 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PGRP06401 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGRP06401 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGRP06401 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGRP06401 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGRP06401 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PGRP06401 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGRP06401 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PGRP06401 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGRP06401 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PGRP06401 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PGRP06401 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PGRP06401 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGRP06401 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGRP06401 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGRP06401 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGRP06401 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PGRP06401 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PGRP06401 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PGRP06401 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGRP06401 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PGRP06401 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGRP06401 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PGRP06401 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms