Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT1P04264 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT1P04264 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT1P04264 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT1P04264 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT1P04264 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT1P04264 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT1P04264 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT1P04264 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KRT1P04264 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KRT1P04264 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT1P04264 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT1P04264 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT1P04264 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT1P04264 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT1P04264 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT1P04264 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT1P04264 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT1P04264 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT1P04264 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT1P04264 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT1P04264 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT1P04264 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT1P04264 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT1P04264 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT1P04264 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT1P04264 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT1P04264 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT1P04264 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT1P04264 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT1P04264 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT1P04264 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT1P04264 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT1P04264 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT1P04264 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT1P04264 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT1P04264 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT1P04264 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT1P04264 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT1P04264 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT1P04264 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT1P04264 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT1P04264 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms